summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/api
ModeNameSize
-rw-r--r--a2ferr.h2122logplain
-rw-r--r--a2ferr.msg3936logplain
-rw-r--r--a2ferrdf.h894logplain
-rw-r--r--a2fstruc.h7162logplain
-rw-r--r--alignmgr.c335495logplain
-rw-r--r--alignmgr.h47133logplain
-rw-r--r--alignmgr2.c320057logplain
-rw-r--r--alignmgr2.h39506logplain
-rw-r--r--alignval.c61944logplain
-rw-r--r--alignval.h3800logplain
-rw-r--r--aliparse.c98392logplain
-rw-r--r--aliparse.h3937logplain
-rw-r--r--aliread.c35309logplain
-rw-r--r--aliread.h2474logplain
-rw-r--r--asn2ff.h7143logplain
-rw-r--r--asn2ff1.c147076logplain
-rw-r--r--asn2ff2.c71794logplain
-rw-r--r--asn2ff3.c143747logplain
-rw-r--r--asn2ff4.c76580logplain
-rw-r--r--asn2ff5.c83798logplain
-rw-r--r--asn2ff6.c102848logplain
-rw-r--r--asn2ff6.h9529logplain
-rw-r--r--asn2ffg.h15931logplain
-rw-r--r--asn2ffp.h19562logplain
-rw-r--r--asn2gnb1.c155025logplain
-rw-r--r--asn2gnb2.c153973logplain
-rw-r--r--asn2gnb3.c154792logplain
-rw-r--r--asn2gnb4.c212944logplain
-rw-r--r--asn2gnb5.c110691logplain
-rw-r--r--asn2gnb6.c118075logplain
-rw-r--r--asn2gnbi.h30126logplain
-rw-r--r--asn2gnbk.h5156logplain
-rw-r--r--asn2gnbp.h7490logplain
-rw-r--r--blocks.c99599logplain
-rw-r--r--blocks.h9087logplain
-rw-r--r--codon.c18596logplain
-rw-r--r--codon.h7070logplain
-rw-r--r--ddvcolor.c59266logplain
-rw-r--r--ddvcolor.h30463logplain
-rw-r--r--edutil.c181605logplain
-rw-r--r--edutil.h31355logplain
-rw-r--r--errdefn.h792logplain
-rw-r--r--explore.h22252logplain
-rw-r--r--fastadl.asn2191logplain
-rw-r--r--fastadl.h2307logplain
-rw-r--r--fdlKludge.h4139logplain
-rw-r--r--fdlobj.c8071logplain
-rw-r--r--fdlobj.h2093logplain
-rw-r--r--ffprint.c27493logplain
-rw-r--r--ffprint.h9723logplain
-rw-r--r--findrepl.c58781logplain
-rw-r--r--findrepl.h5189logplain
-rw-r--r--ftusrstr.c4067logplain
-rw-r--r--ftusrstr.h1608logplain
-rw-r--r--gather.c190284logplain
-rw-r--r--gather.h27656logplain
-rw-r--r--gbfeat.c50747logplain
-rw-r--r--gbfeat.h5004logplain
-rw-r--r--gbftdef.h9921logplain
-rw-r--r--gbftglob.c50662logplain
-rw-r--r--gbparint.c75343logplain
-rw-r--r--gbparlex.h2974logplain
-rw-r--r--jsavlt.c12841logplain
-rw-r--r--jsavlt.h1918logplain
-rw-r--r--jzcoll.c134875logplain
-rw-r--r--jzcoll.h26273logplain
-rw-r--r--jzmisc.c50738logplain
-rw-r--r--jzmisc.h7341logplain
-rw-r--r--lsqfetch.c55723logplain
-rw-r--r--lsqfetch.h9378logplain
-rw-r--r--maputil.c59862logplain
-rw-r--r--maputil.h22183logplain
-rw-r--r--mconsist.c8410logplain
-rw-r--r--mconsist.h3439logplain
-rw-r--r--needleman.c20952logplain
-rw-r--r--needleman.h1985logplain
-rw-r--r--objmgr.c135343logplain
-rw-r--r--objmgr.h54814logplain
-rw-r--r--parsegb.h5236logplain
-rw-r--r--pgppop.c125413logplain
-rw-r--r--pgppop.h19077logplain
-rw-r--r--prtutil.c46975logplain
-rw-r--r--prtutil.h8175logplain
-rw-r--r--puberr.h134logplain
-rw-r--r--salpacc.c36584logplain
-rw-r--r--salpacc.h5848logplain
-rw-r--r--salpedit.c97733logplain
-rw-r--r--salpedit.h2160logplain
-rw-r--r--salprop.c46362logplain
-rw-r--r--salprop.h3586logplain
-rw-r--r--salpstat.c90584logplain
-rw-r--r--salpstat.h12728logplain
-rw-r--r--salsa.h12469logplain
-rw-r--r--salsap.c139921logplain
-rw-r--r--salsap.h8544logplain
-rw-r--r--salstruc.c84740logplain
-rw-r--r--salstruc.h4939logplain
-rw-r--r--salutil.c96865logplain
-rw-r--r--salutil.h14254logplain
-rw-r--r--samutil.c180476logplain
-rw-r--r--samutil.h36462logplain
-rw-r--r--satutil.c34890logplain
-rw-r--r--satutil.h4233logplain
-rw-r--r--seqmgr.c325139logplain
-rw-r--r--seqmgr.h51399logplain
-rw-r--r--seqport.c211639logplain
-rw-r--r--seqport.h37302logplain
-rw-r--r--sequtil.c281181logplain
-rw-r--r--sequtil.h54284logplain
-rw-r--r--simple.c12500logplain
-rw-r--r--simple.h3791logplain
-rw-r--r--sqnutil1.c297156logplain
-rw-r--r--sqnutil2.c235023logplain
-rw-r--r--sqnutil3.c115591logplain
-rw-r--r--sqnutils.h34199logplain
-rw-r--r--subutil.c126654logplain
-rw-r--r--subutil.h58446logplain
-rw-r--r--tofasta.c148326logplain
-rw-r--r--tofasta.h21665logplain
-rw-r--r--tofile.c14086logplain
-rw-r--r--tofile.h3186logplain
-rw-r--r--tomedlin.c50410logplain
-rw-r--r--tomedlin.h7480logplain
-rw-r--r--txalign.c213444logplain
-rw-r--r--txalign.h27959logplain
-rw-r--r--udvdef.h7897logplain
-rw-r--r--udvseq.c39212logplain
-rw-r--r--udvseq.h11171logplain
-rw-r--r--undefwin.h2439logplain
-rw-r--r--utilpars.c8110logplain
-rw-r--r--utilpars.h2358logplain
-rw-r--r--utilpub.c39446logplain
-rw-r--r--utilpub.h2513logplain
-rw-r--r--valid.c582579logplain
-rw-r--r--valid.h10403logplain
-rw-r--r--valid.msg37141logplain
-rw-r--r--validatr.h901logplain
-rw-r--r--validatr.msg741logplain
-rw-r--r--validerr.h12163logplain
-rw-r--r--viewmgr.c34078logplain
-rw-r--r--viewmgr.h13649logplain
-rw-r--r--wprint.c65330logplain