index
:
bcftools
master
Debian dgit repo for package bcftools
summary
refs
log
tree
commit
diff
log msg
author
committer
range
Mode
Name
Size
-rw-r--r--
AUTHORS
389
log
plain
-rw-r--r--
HMM.c
11917
log
plain
-rw-r--r--
HMM.h
4507
log
plain
-rw-r--r--
INSTALL
1989
log
plain
-rw-r--r--
LICENSE
37442
log
plain
-rw-r--r--
Makefile
8124
log
plain
-rw-r--r--
README
246
log
plain
-rw-r--r--
bcftools.h
2184
log
plain
-rw-r--r--
call.h
4957
log
plain
-rw-r--r--
ccall.c
13597
log
plain
-rw-r--r--
consensus.c
25139
log
plain
-rw-r--r--
convert.c
35380
log
plain
-rw-r--r--
convert.h
1566
log
plain
d---------
doc
162
log
plain
-rw-r--r--
em.c
8856
log
plain
-rw-r--r--
filter.c
60909
log
plain
-rw-r--r--
filter.h
1941
log
plain
-rw-r--r--
gvcf.c
3091
log
plain
-rw-r--r--
khash_str2str.h
2724
log
plain
-rw-r--r--
kmin.c
7269
log
plain
-rw-r--r--
kmin.h
1619
log
plain
-rw-r--r--
main.c
8272
log
plain
-rw-r--r--
mcall.c
55831
log
plain
-rw-r--r--
ploidy.c
6665
log
plain
-rw-r--r--
ploidy.h
4253
log
plain
-rwxr-xr-x
plot-vcfstats
80508
log
plain
d---------
plugins
385
log
plain
-rw-r--r--
polysomy.c
25887
log
plain
-rw-r--r--
prob1.c
20291
log
plain
-rw-r--r--
prob1.h
3539
log
plain
-rw-r--r--
rbuf.h
5727
log
plain
-rw-r--r--
reheader.c
16847
log
plain
-rw-r--r--
tabix.c
5748
log
plain
d---------
test
9351
log
plain
-rw-r--r--
tsv2vcf.c
3603
log
plain
-rw-r--r--
tsv2vcf.h
2621
log
plain
-rw-r--r--
vcfannotate.c
70564
log
plain
-rw-r--r--
vcfcall.c
28350
log
plain
-rw-r--r--
vcfcnv.c
38371
log
plain
-rw-r--r--
vcfconcat.c
26494
log
plain
-rw-r--r--
vcfconvert.c
53363
log
plain
-rw-r--r--
vcffilter.c
22182
log
plain
-rw-r--r--
vcfgtcheck.c
33358
log
plain
-rw-r--r--
vcfindex.c
8478
log
plain
-rw-r--r--
vcfisec.c
23546
log
plain
-rw-r--r--
vcfmerge.c
80035
log
plain
-rw-r--r--
vcfnorm.c
74929
log
plain
-rw-r--r--
vcfplugin.c
18604
log
plain
-rw-r--r--
vcfquery.c
14213
log
plain
-rw-r--r--
vcfroh.c
26945
log
plain
-rw-r--r--
vcfsom.c
23858
log
plain
-rw-r--r--
vcfstats.c
59874
log
plain
-rwxr-xr-x
vcfutils.pl
18199
log
plain
-rw-r--r--
vcfview.c
33369
log
plain
-rw-r--r--
vcmp.c
3812
log
plain
-rw-r--r--
vcmp.h
2387
log
plain
-rw-r--r--
version.c
1604
log
plain